Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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