Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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