Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp27Q8CEG8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp27Q8CEG8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp27Q8CEG8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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