Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc38Q8CDN8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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