Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms