Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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