Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg16l1Q8C0J2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg16l1Q8C0J2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg16l1Q8C0J2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg16l1Q8C0J2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg16l1Q8C0J2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg16l1Q8C0J2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg16l1Q8C0J2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Atg16l1Q8C0J2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Atg16l1Q8C0J2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Atg16l1Q8C0J2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Atg16l1Q8C0J2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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