Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms