Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc12Q8BW49 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms