Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pdcl3Q8BVF2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pdcl3Q8BVF2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcl3Q8BVF2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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