Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmod1Q8BVA4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms