Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tspan12Q8BKT6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tspan12Q8BKT6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms