Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms