Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ubash3bQ8BGG7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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