Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htatsf1Q8BGC0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms