Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms