Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ttc28Q80XJ3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ttc28Q80XJ3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms