Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms