Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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