Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Actn1Q7TPR4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Actn1Q7TPR4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms