Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms