Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ubfd1Q78JW9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ubfd1Q78JW9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ubfd1Q78JW9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ubfd1Q78JW9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ubfd1Q78JW9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ubfd1Q78JW9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ubfd1Q78JW9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ubfd1Q78JW9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ubfd1Q78JW9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubfd1Q78JW9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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