Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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