Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Topbp1Q6ZQF0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms