Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms