Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms