Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtminQ6P9S1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms