Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tpm4Q6IRU2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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