Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Krt40Q6IFX3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Krt40Q6IFX3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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