Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarca2Q6DIC0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarca2Q6DIC0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms