Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZT1

Fan1, Fanconi-associated nuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fan1Q69ZT1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fan1Q69ZT1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fan1Q69ZT1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fan1Q69ZT1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fan1Q69ZT1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fan1Q69ZT1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fan1Q69ZT1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fan1Q69ZT1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fan1Q69ZT1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fan1Q69ZT1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fan1Q69ZT1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fan1Q69ZT1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms