Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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