Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Capn3Q64691 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Capn3Q64691 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Capn3Q64691 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms