Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ift52Q62559 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ift52Q62559 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ift52Q62559 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ift52Q62559 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms