Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Lama3Q61789 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Lama3Q61789 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Lama3Q61789 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Lama3Q61789 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Lama3Q61789 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Lama3Q61789 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lama3Q61789 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms