Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxj1Q61660 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms