Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tfap2bQ61313 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms