Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Usf1Q61069 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Usf1Q61069 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Usf1Q61069 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Usf1Q61069 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf1Q61069 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Usf1Q61069 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Usf1Q61069 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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