Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms