Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Slc6a4Q60857 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Slc6a4Q60857 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Slc6a4Q60857 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Slc6a4Q60857 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Slc6a4Q60857 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Slc6a4Q60857 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Slc6a4Q60857 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Slc6a4Q60857 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Slc6a4Q60857 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc6a4Q60857 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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