Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cnot7Q60809 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cnot7Q60809 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cnot7Q60809 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cnot7Q60809 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cnot7Q60809 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cnot7Q60809 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cnot7Q60809 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cnot7Q60809 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cnot7Q60809 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Cnot7Q60809 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Cnot7Q60809 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Cnot7Q60809 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Cnot7Q60809 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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