Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf123Q5XPI3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf123Q5XPI3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf123Q5XPI3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf123Q5XPI3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf123Q5XPI3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf123Q5XPI3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf123Q5XPI3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf123Q5XPI3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf123Q5XPI3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf123Q5XPI3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf123Q5XPI3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms