Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms