Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Znf608Q56A10 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Znf608Q56A10 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf608Q56A10 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms