Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eme2Q56A04 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms