Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc47Q505F5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc47Q505F5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc47Q505F5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrrc47Q505F5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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