Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms