Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm5aQ3UXZ9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms