Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
D130052B06RikQ3UW13 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
D130052B06RikQ3UW13 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
D130052B06RikQ3UW13 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
D130052B06RikQ3UW13 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
D130052B06RikQ3UW13 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
D130052B06RikQ3UW13 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
D130052B06RikQ3UW13 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
D130052B06RikQ3UW13 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
D130052B06RikQ3UW13 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
D130052B06RikQ3UW13 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
D130052B06RikQ3UW13 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
D130052B06RikQ3UW13 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms