Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fchsd2Q3USJ8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms